Photoshopで透明ピクセルをロック(保護)する場合はレイヤーパネルからロックしますが、Affinity Photoの場合はブラシツールを選択し、オプションバー(コンテキストツールバー)で[アルファの保護]にチェックを入れます。

iPad版の場合、ブラシツールのコンテキストツールバーは画面の下にあります。
その中で(α)ボタンをタップします。
Affinity Designer・Photo・Publisher日本語マニュアル
Photoshopで透明ピクセルをロック(保護)する場合はレイヤーパネルからロックしますが、Affinity Photoの場合はブラシツールを選択し、オプションバー(コンテキストツールバー)で[アルファの保護]にチェックを入れます。
iPad版の場合、ブラシツールのコンテキストツールバーは画面の下にあります。
その中で(α)ボタンをタップします。